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——中国科学家解读牡丹基因组,成功填补芍药科植物基因组研究空白
【中华时报/中华信息通讯社河南报】(陈俊武孟梅)年9月26日上午9时,洛阳牡丹基因组测序成果新闻发布会在洛阳市会议中心5楼会议室隆重召开。 深圳华大基因研究院相关负责人、洛阳市农科院相关负责人及洛阳市市委副书记、市长刘旺康等领导发表重要讲话,阐述洛阳牡丹快速发展的历史和起源。
“洛阳地脉花最适合,牡丹尤天下奇”。 被誉为“千年帝都、牡丹花城”的洛阳一直是国内牡丹研究和栽培中心,具有悠久的牡丹栽培历史、丰富的牡丹栽培资源和良好的牡丹产业基础,开展和应用基因研究,实现牡丹科学研究上的根本性创新,牡丹育种周期长、效率低等技术
年12月,洛阳市人民政府、深圳华大基因签署协议,共同开展洛阳牡丹基因组学研究。 首要任务是开展洛阳牡丹基因组测序和牡丹遗传多样化、洛阳牡丹分子育种研究。 其中最重要、最基础、最核心的任务是牡丹基因组测序研究。
牡丹基因组极其繁多复杂,高达12.5 gb (约为人类基因组的4.5倍)。 在华大基因和洛阳农林科学院双方的共同努力下,经过近三年的合作攻关,调动了包括国家银河超算在内的各种科研资源,应用世界上最先进的第三代测序技术,完成了2.67 tb的第二代高通量数据,1.49 tb的第三代测序数据。
牡丹基因组的解读,在国际植物基因组研究中填补了芍药科植物基因组的空白色,使来自中国的花卉品种完美地出现在世界基因研究行业,在牡丹研究方面具有里程碑意义。 总结这项研究成果,我们领导了三个世界。 引领牡丹基因组详细图的绘制,让“数字化牡丹”变得精彩。 牡丹基因组的组装尺寸为12.25 gb,剪接片段contigs n50 = 128kb,基因组完整度为98%,两端的比对率为98.8%,锚定染色体为85%,完成了巨大基因组的三代测序。 二是先行注释65898个牡丹基因,使“定制化牡丹”成为可能。 获得牡丹的花型、花色调控基因及牡丹籽油合成的相关基因,为精准化牡丹分子育种提供技术支持。 三是领导建立按钮基因组和表型数据库,获得“新闻化按钮”。 根据研究成果建设牡丹基因组数据库,覆盖1000余部牡丹品种资源,从基因视角对牡丹进行分类筛选,实现了大数据查询的应用。
牡丹基因组测序的完成,标志着洛阳牡丹科学研究全面推进基因时代,洛阳牡丹科学研究水平达到世界领先水平。 基于该研究成果,一是可以更科学地进行牡丹品种资源的追溯、保护工作。 二是能实现牡丹精确定向分子育种。 三是能加快牡丹产业化的快速发展。
通过大力开展牡丹基因组应用研究,全面推动洛阳牡丹生产标准化、规模化快速发展,使洛阳成为世界牡丹产业快速发展的中心。 会议结束后,洛阳市市委副书记、市长刘旺康等率领一行参观了洛阳牡丹基因组测序成果图片展示,提出了宝贵意见。
最后,洛阳市委副书记、市长刘旺康等相关领导一起合影留念,祝愿这次新闻发布会圆满成功。
标题:“洛阳牡丹基因组测序成果新闻发表会隆重召开”
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