“我科学家完成海湾紫扇贝基因组测序和组装”

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科技日报记者王健高通讯员周维维

月25日，青岛农业大学由该校海洋科学与工程学院教授王春德课题组和合作单位自主研究开发海湾扇贝两个亚种的基因组测序和组装，近期相关研究成果在线发表在nature开源期刊scientific data上

迄今为止，王春德课题组已完成紫扇贝基因组的测序和组装，成功完成了紫扇贝和湾扇贝两个亚种基因组的测序，从分子水平分析了湾扇贝及其杂交后代的生长、抗性、育性和寿命等重要性状决定机制和分子育种。

王春德表示，此次他们的科研团队在扇贝育种研究上再次取得重要进展，成功对扇贝北部亚种和南部亚种基因组进行了测序和解体。

王春德课题组用二代和三代测序相结合的方法测序和组装了海湾扇贝两个亚种的基因组。 其中北部亚种获得253.17 gb原始数据，组装835.7mb基因组，占海湾扇贝北部亚种估计基因组大小996.07的83.9%，其contig n50和scaffold n50分别为78.54 kb和1.53 mb， 取得南部亚种测序数据272.97gb，组装的基因组大小为874.82 mb，占南部亚种估计基因组大小974.30的89.79%，其contig n50和scaffold n50分别为63.73 kb和1.25 mb。 系统演化分析表明，扇贝的两个亚种先聚集在一起，然后与扇贝聚集在一起，再与其他双壳贝类聚集在一起，然后与腹足纲种聚类。 两湾扇贝亚种的分支时期为26.4百万年，与扇贝的分支时期为85.9百万年前。

该科研成果由青岛农业大学和浙江海洋大学、中国科学院烟台海岸地带研究所等单位共同完成。 论文作者是青岛农业大学教授王春德，第一作者是浙江海洋大学教授刘晓。