“重器重用，超级算力加速新冠病毒基因组特点研究”

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科学技术日报记者刘艳

正如国家超级计算深圳中心主任冯圣中所说，“科学阻止疫情的各个环节，需要超算支持。 ”。

3月3日，英特尔、联想、华大基因宣布加快解析covid-19新型冠状病毒的基因组特征。 这种合作有助于华大基因继续优化新型冠状病毒检测试剂盒，获取大量有价值的新闻，揭示开发较有效疫苗和治疗方法的潜在靶点。

联想高级副总裁童夫尧、公司科技集团总裁表示，“来自英特尔和联想的大数据观察和健康与生命科学专家，将整合我们的资源和专业技术，应对当前面临的严峻挑战，推进健康与生命科学的快速发展进程。”

在包括英特尔和联想为华大基因提供的硬件、软件、提供和服务在内的端到端处理方案中，大型高性能计算( hpc )集群将从华大dnbseq-t7测序系统读取的高通量数据 这些事业对于将来制定更好的诊断方法和设计有效的疫苗和其他保护措施(免疫疗法等)至关重要。

在软件方面，通过英特尔和联想的共同努力，联想的超级计算技术得到支持和优化的“基因组优化和可扩展性工具”( goast，英特尔精选处理方案验证的第一个基因组分析工具)，

英特尔企业营销集团副总裁兼中国区总经理王盼表示:“华大基因需要通过分析病毒基因组数据，为感染者的快速识别和基因组特征的研究投入巨大的计算资源，这就是我们能够发挥作用的地方。”

在基因测序工作中，每毫升体液含有数百万个不同的病毒体，但各病毒体的基因组中含有约30，000个dna碱基或文字。 华大基因目前将对感染患者和疑似感染患者的微生物基因测序研究工作产生tb级至pb级的大量数据。

“华大基因已经测序了数百个临床样本，对感染的并发症进行了分解和区分。 ”。 华大基因首席发言人晋前表示，“基因组比对、基因组组装、基因组注释和病毒核酸片段的系统分解，是一个高密度的计算过程，采用最新的高性能计算和基因组分解技术是提高分解效率的重要因素。 这些设备和技术将加快新型冠状病毒感染者的快速识别和病毒基因组特征的研究，为新型冠状病毒的精确诊断、治疗和疫情防控提供有力支撑。 ”。

(科技日报北京3月3日电)